近日,《自然—通訊》在線發(fā)表了中國農(nóng)業(yè)大學動物科技學院家禽遺傳育種團隊侯卓成教授課題組的最新研究成果。
家鴨品種大部分由原始的綠頭野鴨馴化而來。相較于野鴨,家養(yǎng)品種在繁殖和生長性能上有極其顯著的提高。針對不同的生產(chǎn)需要,鴨有兩個選育方向,分別為肉鴨和蛋鴨。肉鴨的主要品種為北京鴨,北京鴨是全球大型白羽肉鴨育種的標準品種,被各國育種公司作為肉鴨育種的原始素材。高質(zhì)量參考基因組及其泛基因組研究是基因組學研究的重要基礎,同時也是分子設計育種、遺傳學等研究的關鍵基礎科學數(shù)據(jù)。
為了闡明家養(yǎng)化過程中重要性狀的變化規(guī)律,并且為分子育種提供高質(zhì)量參考基因組,在這項研究中,研究人員分別組裝了北京鴨、紹興鴨和綠頭野鴨的染色體級別高質(zhì)量基因組,注釋了數(shù)千個新的蛋白質(zhì)編碼基因,并發(fā)現(xiàn)鳥類被認為的“缺失基因”在基因組中存在,進一步否定了鳥類“缺失基因假說”。
該研究首次在鳥類基因組中獲得調(diào)控蛋殼生物鈣化的必需C型凝集素家族成員的完整基因組序列;利用比較基因組和群體測序數(shù)據(jù),鑒定到了家養(yǎng)化過程不同類型鴨群體中存在的關鍵遺傳變異;該研究利用敲除模型證實了NR2F2基因在鴨體內(nèi)的抑制脂肪生成的功能。
研究成果為解讀鳥類蛋殼形成的遺傳機制提供了新的理論依據(jù),也為鴨的性狀改良提供了豐富的遺傳變異資源。